西元1995年
本年為台灣光復50週年，僑委會章孝嚴主任委員、總統府資政蔣彥士博士、宋楚瑜省長相繼蒞臨本校。
01月29日
僑委會章孝嚴主任委員暨夫人蒞校參訪。
06月17日
八十三學年度畢業典禮邀請行政院大陸委員會蕭萬長主委蒞校，並專題演講─「開拓兩岸關係的視野」。
08月01日
增設碩士班：食品技術系1班。
新設三專畢業生在職進修班二年制：森林資源技術系、水產養殖技術系、畜牧生產技術系、獸醫學系、機械工程技術系等5系各1班。
10月03日
全校週會，邀請總統府資政蔣彥士博士蒞校專題演講一「台灣農業技術及職業教育之現況與展望」。
10月20日
省政府宋楚瑜省長蒞校並夜宿木屋。
10月21日
慶祝抗戰勝利暨台灣光復五十週年舉辦校園路跑活動。
西元1996年
本校今年極力推動豬隻養殖、豬隻品種改良等技術之精進，因此特辦理「第一屆海峽兩岸養豬研討會」、「最新養豬技術研討會」、「豬隻品種改良研討會」及「第一屆動物行為研討會」等學術交流活動，希冀帶動我國培養豬隻相關專業人才。
西元1997年
本校正式更名為「國立屏東科技大學」，首任校長由劉顯達博士擔任，亦增設農業、工業、管理等科技學院。
11月25日
與加拿大果爾夫大學(University of Guelph)締結姊妹校典禮，兩校簽約中明訂師資、學生、媒體等交換辦法。
12月13日
野生動物保育系主辦「南亞及東南亞野生動物收容中心管理研討會」。
01月07日
全校週會邀請中央研究院院長李遠哲博士蒞校專題講演—「迎接新世紀的來臨」。
01月11日
(1) 本校「校長連任」提請行使同意案，並通過同意劉顯達校長連任，任期至九
十年九月二日止。
(2) 通過本校改名科技大學計畫書及本校五年（八十六至九十學年度）發展計畫書。
05月04日
土木系邀請吳淡如小姐蒞校專題演講「校園戀愛學分」。
05月17日
亞洲鐵人楊傳廣先生陪同陸戰隊司令王玉中將蒞校拜會校長商談現代五項運動訓練事宜。
08月01日
成立科技大學，更名為「國立屏東科技大學」，設有農業、工業、管理等三個科技學院；劉顯達博士任首任大學校長。
增設：
碩士班：熱帶農業研究所、獸醫學系等2所系各1班。
日間部二年制：野生動物保育技術系1班。
日間部四年制：畜牧生產技術系、環境保護技術系等2系各1班。
停招日間部二年制：畜牧生產技術系1班。
減班：環境保護技術系日間部二年制原3班減1班為2班。
09月27日
故宮博物院秦孝儀院長蒞校參觀訪問。
11月22日至11月23日
八十六學年度校慶特舉辦慶祝活動，包括體育館落成典禮、校史照片回顧展、校景寫生美術展、攝影展及運動會啦啦隊表演等。
西元1998年
本校今年積極推動國際交流及合作，並在產學合作上簽訂各項策略聯盟，提供農業及車輛研究上的教學實務之推動，此外為隨時代之改變及培育多元化之人才，諸多科系經調整後更名。
01月12日
與宏都拉斯薩莫瑞諾(Zamorano)農業技術學院簽訂兩校學術合作合約。
02月16日
與加拿大曼尼托巴大學(University of Manatoba)舉行諦結姊妹校換約典禮。
04月14日
與國際人道協會共同簽署備忘錄(改善國內流浪犬處理水準與提昇國際形象)。
08月30日
與日本酪農學園大學締結合約。
09月20日
與泰國農業大學(Kasetsart)大學締結合約並訪問本校姊妹校納梨宣大學(Naresuan)研商學術合作交流計畫。
05月25日
與美國北卡羅萊納州立大學、伊利諾技術學院、愛荷華州立大學、俄勒岡州立大學暨普渡大學等五所大學簽訂合作備忘錄暨舉行成立「家畜廢棄物管理中心」動土奠基典禮。
07月09日
亞洲蔬菜研究發展中心簽訂備忘錄，共同合作推行熱帶地區蔬菜生產相關教學、研究與發展。
10月09日
與大慶汽車工業有限公司簽訂合約成立策略聯盟並贈送車輛系相關設備。
04月21日
技藝訓練中心設立之「流浪動物管理人員訓練中心」落成典禮暨解決流浪犬問題研討會。
11月07日
與和泰汽車(TOYOTA)公司簽訂合作聯盟，並贈車輛系車輛乙台供學生實習之用。
11月28日至11月29日
八十七學年度校慶暨農機具陳列館開幕典禮活動。
08月01日
更名：
工業科技學院更名為「工程科技學院」。
農園生產技術系更名為「農園生產系」。
森林資源技術系更名為「森林系」。
畜牧生技術系更名為「畜產系」。
水產養殖技術系更名為「水產養殖系」。
野生動物保育技術系更名「野生動物保育系」。
林產加工技術系更名為「木材工業系」。
植物保護技術系更名為「植物保護系」。
食品技術系更名為「食品科學系」。
環境保護技術系更名為「環境工程與科學系」。
機械工程技術系更名為「機械工程系」。
土木工程技術系更名為「土木工程系」。
車輛工程技術系更名為「車輛工程系」。
水土保持技術系更名為「水土保持系」。
農企業管理技術系更名為「農企業管理系」。
農村規劃技術系更名為「農村規劃系」。
生活應用科學技術系更名為「生活應用科學系」。
資訊管理技術系更名為「資訊管理系」。
工業管理技術系更名為「工業管理系」。
企業管理技術系更名為「企業管理系」。
幼兒保育技術系更名為「幼兒保育系」。
增設：
日間部四年制：森林系、植物保護系、水土保持系等3系各1班。
進修部四年制：幼兒保育系1班。
停招：
日間部二年制：森林系、植物保護系、水土保持系等3系各1班。
三專畢業生在職進修班二年制：森林資源技術系、水產養殖技術系、畜牧生產技術系、獸醫學系、機械工程技術系等5系各1班。
08月03日
協辦亞太區童子軍第二十屆、中國童子軍第八屆大露營，開幕典禮由連戰副總統主持。
西元1999年
本年度為因應「921大地震」，本校全體教職員投入賑災活動，且縮減校慶活動項目及預算，並交由教育部統籌運用。
04月21日
與韓國國立韓京大學簽訂姊妹校合作交流合約，成為本校第十七個外國之姊妹校。
05月19日
與姊妹校維吉尼亞州立綜合大學續簽學術交流合約。
08月20日
與越南河內科學大學(Hanoi University of Science)簽訂學術合作交流協議書。
10月29日
與荷蘭瓦赫寧恩大學簽訂學術交流合約。
02月05日至02月08日
舉辦「農業生物科技研討會」，獲得業界之迴響。
12月01日
與行政院勞委會職訓局南區職業訓練中心簽訂合作協議書。
03月12日
全國造林活動假本校舉行。
06月19日
李登輝總統蒞臨本校八十七學年度畢業典禮，並向全體畢業生致賀。
08月01日
新設：碩士在職專班：環境工程與科學系、土木工程系等2系各1班。
增設：
碩士班：森林系、水土保持系、農企業管理系、畜產系等4系各1班。
日間部四年制：水產養殖系、木材工業系、土木工程系等3系各1班。
進修部二年制：車輛工程系1班。
停招：
日間部二年制：水產養殖系1班。
進修部二年制：畜產系1班。
減班：土木工程系日間部二年制原2班減1班為1班。
09月23日
全體教職員工生響應921大地震賑災活動，共捐出新台幣2,818,690元整，分二次匯入內政部921賑災051043號專戶。
09月30日
因應921大地震所需救災及重建財源，依教育部通報，縮減校慶活動項目。將校慶活動預算經費移繳教育部統籌運用。
11月05日至11月06日
管理科技學院舉辦「跨世紀海峽兩岸永續企業經營研討會」，與會貴賓包括中華民國管理科學學會理事長許士軍博士、海峽交流基金會吳新興副秘書長。
西元2000年
本校今年在國際合作上積極與美洲地區大專校院簽屬學術暨合作交流協定，同時將農業、工程、管理科技學院更名為農、工、管理學院，並增設人文暨社會科學院，擴大本校在教學領域的完整性。
12月22日
通過貝爾國際驗證股份有限公司之認證，獲得ISO 9001-2000年版國際標準品質保證制度證明書。
01月14日
海地共和國總理亞雷克西(S.E.M. Jacques Edouard Alexis)暨夫人蒞校參訪；海地基斯克亞大學(Quisqueya)與本校進行學術交流暨簽訂合約事宜。
02月01日
與加拿大Olds College 大學簽署學術合作交流協議書。
02月10日
與海地基斯克亞大學(Quisqueya)共同簽訂合作備忘錄。
04月17日
與澳洲新英格蘭大學(University of New England) 簽訂學術合作備忘錄。
11月03日
索羅門群島總理蘇嘉法瑞(H.E Manassch Sogavare)暨夫人蒞校參訪。
11月03日
管理學院主辦「第二屆永續發展管理研討會－新世紀經營與管理暨製商整合管理研討會」。
11月16日
珍古德博士（Dr. Jane Goodall）蒞校參觀本校野生動物收容中心、技藝訓練中心流浪動物管理人員訓練中心。
02月14日
與大田精密工業股份有限公司暨榮剛材料科技股份有限公司三方共同簽署策略聯盟協議(推動產業科技術發展，建立教育與研發夥伴關係、加強合作以及培訓金屬材料相關工業之高級技職人才)。
04月06日
李登輝總統蒞校參觀技藝訓練中心設施。
08月01日
更名：農業、工程、管理科技學院更名為農、工、管理學院。
新設：
博士班：食品科學系1班。
在職專班二年制：機械工程系1班(招收一屆)。
增設：
人文暨社會科學院。
碩士班：植物保護系、工業管理系班等2系各1班。
碩士在職專班：森林系、畜產系、獸醫學系、食品科學系、機械工程系等5系各1班。
日間部二年制：應用外語系1班。
日間部四年制：機械工程系、車輛工程系、生物系統工程系、資訊管理系、企業管理系、社會工作等6系各1班。
停招日間部二年制：生活應用科學系、資訊管理系等2系各1班。
減班：農企業管理系日間部二年制原2班減1班為1班、機械工程系日間部二年制原3班減1班為2 班。
11月01日
借用達仁林場(佔地629.4公頃)，供作本校師生實習、教學、推廣研究。
12月12日
邀請明華園當家小生孫翠鳳小姐蒞校作「人生有夢築夢踏實－職場生涯的十字路口」專題演講。
西元2001年
為深化在花東地區農業推廣之關係，本校與花東地區公部門締結教育合作夥伴及簽署協議書，同年8月位於台東縣達仁鄉之達仁林場教育部同意撥用予本校使用，成為日後提供師生實務教學與實習之重要場所。
03月01日
辦理國際品保，榮獲英國皇家UKAS認證、EAQA驗證通過品質管理系統ISO9001：2000驗證合格。
10月20日
與巴拉圭國立亞松森大學(Universidad Nacional de Asuncion)簽署學術合作協議書。
07月18日
與花蓮縣政府、花蓮高農、花蓮區農業改良場、花蓮林區管理處、花蓮縣農會等簽署締結教育夥伴關係聯盟，共同推動合作事宜。
08月27日
配合行政院「廿一世紀農業新方案」及「促進東部產業發展計畫」，與台東縣政府、台東高級農工職校、台東地區農會締結簽署教育夥伴協議書。
04月13日
土木系主辦「第四屆地下水資源及水質保護研討會」。
08月01日
附設達仁林場，教育部於90年12月20日同意無償撥用，位於臺東縣達仁鄉，佔地約576公頃。
增設：
博士班：熱帶農業研究所、獸醫學系等2所系各1班。
碩士班：水產養殖系、野生動物保育系、生物科技研究所、木材工業系、企業管理系、技術及職業教育研究所等6所系各1班。
碩士在職專班：農企業管理系、資訊管理系、工業管理系等3系各1班。
日間部四年制：服飾科學管理系、餐旅管理系、工業管理系等3系各1班。
進修部四年制：社會工作系1班。
停招：
日間部二年制：野生動物保育系、工業管理系等2系各1班。
日間部四年制：生活應用科學系1班。
進修部四年制：生活應用科學系1班。
減班：機械工程系日間部二年制原2班減1班為1班。
11月09日
管理學院主辦第三屆永續發展管理研討會－「知識產業經營與管理」。
12月15日
陳水扁總統蒞校，參加由中華農學團體年會開幕致詞及表揚。
西元2002年
本校持續與國際學校締結姊妹校與簽訂學術交流合作，同年8月世界科學院周昌弘院士經遴選並獲教育部聘為本校第二任校長。
03月28日
與泰國清邁大學(Chiang Mai University)締結姊妹校簽約典禮，為本校第27所姊妹。
07月31日
與奧克拉荷馬州立大學(Oklahoma State University)簽訂學術交流及合作協議書。 08月19日
與塞內加爾共和國食品工業研究所簽署合作協議書。
09月19日
與帛琉共和國簽訂合作交流協議書。
10月16日
與菲律賓國立瑪利安諾－馬可仕大學（Mariano Marcos State University）簽訂學術交流及合作協議書。
05月15日
創新育成中心與觧酒莊、台灣良品包裝、參嵥畜產、大揚食品、仁峰、東發製藥及南海珍商行等七家廠商簽訂合作契約。
04月18日
辦理「第十七屆全國技術與職業教育研討會」。
08月01日
周昌弘院士經遴選並獲教育部聘為本校第二任大學校長（第七任校長）。
08月01日
更名：熱帶農業研究所更名為「熱帶農業暨國際合作研究所」。
新設在職專班四年制：社會工作系1班。
增設：
碩士班：車輛工程系、農村規劃系、幼兒保育系、農園生產系等4系各1班。
碩士在職專班：企業管理系、技術及職業教育研究所等2系所各1班。
日間部四年制：休閒運動保健系一班。
停招日間部二年制：農園生產系、獸醫學系、木材工業系、機械工程系、企業管理系等5系各1班。
增班：企業管理系日間部四年制增1班為2班。
調整：野生動物保育系調整為「野生動物保育研究所」。
12月17日
國家地理頻道(National Geographic)的Earth Pulse節目到校製作介紹台灣保育工作之專題。
西元2003年
推動農業合作及交流一直為本校目標之一，本年度積極與國發會、縣政府展開農業發展計畫暨簽約儀式。同年，我國受SARS疫情影響，本校除防範疫情相關措施，亦暫緩舉辦本學年度之畢業典禮。
02月27日
與財團法人國際合作發展基金會簽訂合作協議書(推動國際合作協助開發中國家永續發展)。
03月13日
與屏東縣政府策略聯盟簽約儀式(「促進南部產業發展計畫」及「廿一世紀農業新方案」同意共享行政與學術資源)。
03月21日
與國合會共同簽訂執行計畫(支援本校成立「開發中國家研究中心」，推動雙邊農業技術及學術交流活動)。
09月22月
與國合會、國立政治大學、國立清華大學、國立臺灣海洋大學、國立陽明大學、國立臺灣師範大學等單位，結盟成立「國際合作策略聯盟」，特訂定合作意向書。
07月15日
植物檢疫室暨菇類培養室落成典禮。
07月17日
野生動物保育研究所舉行「遷館暨畢業送舊迎新」典禮。
09月18日
「女生宿舍(慧齋)暨受訓學員宿舍新建工程」謝土及落成啟用典禮。
11月28日
與金頓科技股份有限公司簽訂協議書並為「金頓科技-可靠度實驗室」揭牌，並舉辦振動試驗分析技術與可靠度研討會暨成果展示。
03月23日
首創假日規劃校園「農業暨生態之旅」正式啟動。
04月10日
採取防範「嚴重急性呼吸道症候群」(SARS)預防措施。
06月12日至06月13日
嚴重急性呼吸道症候群(SARS)疫情，暫緩舉行畢業典禮。
08月01日
更名：高階經營管理碩士在職專班學程更名為「高階經營管理碩士在職專班」（教育部中華民國93年6月11日台技二字第0930077629號函，追溯自92學年度）。
增設：
博士班：環境工程與科學系1班。
碩士班：材料工程研究所、財務金融研究所（延緩招生1年）等2所各1班。
碩士在職專班：熱帶農業暨國際合作研究所碩士在職專班台東班、高階經營管理碩士在職專班學程等2所各1班。
日間部四年制：應用外語系1班。
進修部四年制：休閒運動保健系、生物系統工程系等2系各1班。
停招：
日間部二年制：應用外語系1班。
進修部二年制：農園生產系、農企業管理系等2系各1班。
11月28日
呂秀蓮副總統搭專機蒞臨本校祝賀七十九週年校慶。
西元2004年
今年本校展現國際合作及產學合作之競爭力，極力加強永續發展與農業推動、媒合南區大專校院簽署研究與交流合作，另外「動物疫苗檢疫中心」、「水產養殖檢驗服務中心」相繼啟用，強化在地於動物及水產檢驗之能力。
03月01日
保育類野生動物收容中心預訂於3月3日外送雌性紅毛猩猩至英國Monkey World，以強化當地繁殖族群之個體，並感謝由中華航空以CI247全貨機擔負及贊助此次國際運輸作業。
07月24日
呂秀蓮副總統率領拉丁美洲駐台大使與官員20餘人蒞校視察參國際化培訓人才轉移我國先進之農業科技及農業知識。
08月17日至08月25日
與姊妹校貴湖大學(Guelph University)簽訂就學術發展及培訓計畫、交換師生、學術交流、研究合作等協議書。
12月03日
與美國蒙大拿大學（University of Montana）締結姊妹校，簽署締約備忘錄。
12月10日
管理學院主辮「第六屆(2004)永續發展管理研討會－發展、變革、執行力」。
02月22日
與高雄縣政府及成功大學、中山大學、高雄大學、高雄應用科技大學、高雄第一科技大學、輔英科技大學、義守大學、正修科技大學、高苑技術學院）簽訂研究發展合作協議書(南區環保科技園區產業提升技術)。
05月14日
與屏東基督教醫院舉行策略聯盟合作簽約(學術交流、醫療、社區服務)。
05月20日
與高雄商業職業學校締結策略聯盟簽約儀式(教師教學及技藝訓練課程相互支援)。
03月18日
「動物疫苗檢疫中心」正式掛牌運作，由獸醫學系陳石柱教授擔任該中心主任。
04月28日
水產養殖檢驗服務中心啟用儀式(全國第一個具備歐盟農水產藥物殘留檢測規範的實驗室)。
10月09日
餐旅大樓舉行興建動土典禮。
02月20日
農學院主辦「南台灣永續發展論壇－有機農業發展研討會」。
03月29日
授予國際創價學會會長池田大作先生名譽農學博士學位。
05月29日
服飾系承辦「第廿屆全國纖維紡織科技研討會」。
08月01日
本校九十三學年度奉教育部92年9月9日台技(二)字第0920131450號函核准：
更名：木材工業系更名為「木材科學與設計系」。
增設：
博士班：生物資源研究所1班。
碩士班：生物機電工程研究所1班。
四年制日間部：
生命科學系、熱帶農業暨國際合作系（專招生外國籍學生，依教育部中華民國93年6月16日台技二字第0930078399號函）等2系各1班。
在職專班二年制：社會工作系1班。
停招：
日間部二年制：土木工程系、車輛工程系等2系各1班。
進修部二年制：土木工程系、食品科學系等2系各1班。
在職專班二年制：機械工程系1班。
增班：
土木工程系日間部四年制增1班為2班。
碩士在職專班：農企業管理系碩士在職專班花蓮班1班。
調整：
熱帶農業暨國際合作研究所調整為「熱帶農業暨國際合作系」。
「幼兒保育系」組織調整由管理學院歸為人文暨社會科學院。
09月20日
頒授李遠哲先生名譽工學博士學位。
11月10日
農機具陳列館慶祝創校80週年慶，特舉辦「傳統水稻種植器具展演」。
11月18日
工學院主辦「第二屆奈米科技全國K-12教學研討會」。
11月27日
籌辦「產學合作博覽會」，推出「國立屏東科技大學創校八十週年紀念酒」。